Mollet de Peralada forma part de la comarca de l’Alt Empordà, província de Girona. El terme municipal té una extensió de 3 km2. i el poble està a 59m. d’altitud i el punt més alt del terme és el Puig de Mas Ferriols de 101 metres.
Els límits del terme municipal són al nord amb Espolla i Rabós d’Empordà, a l’est amb Garriguella, al sud amb Peralada i a l’oest amb Masarac. Té agregats els nuclis del Barri les Costes i de Casaloca.
